財政部官員則大喊冤枉，認為把大學債務黑洞完全推給政府，不負責任，大學債務危機是多種原因造成，除了擴招，經費不足、大學盲目擴建和投資都有關係。
北京大學"大學負債問題研究"指出，大學負債問題，應是擴招推出後，政府財政支持不足、學生數量急增的雙重壓力下，地方政府、金融機構和大學三方各打如意算盤，促成大學辦學"大躍進"造成的後遺症。
大陸大學貸款始於一九九九年，即大學開始大規模擴大招生的第一年。一九九八年，大學招生一百零八萬人，到了二○○二年，招生人數擴大到二百七十五萬人，數目成倍增長。
自二○○○年起，大學出現學校合併的風潮，講究的是學校規模愈大愈好，於是，各地爭相開發"亞洲第一大"、"中國第一大"的大學城。加上教育部門規定，每名學生要佔多少校園面積，每個專業要達到一定招生量，達不到這些指標，一些專業就被停招，所以，各大學不斷圈地，擴大學校規模。
當時，地方政府想借由大學城建設，帶動當地經濟發展；一些地方政府向大學承諾，未來 可協助學校償還銀行貸款，具體的補助方式有政府全額還本付息，大學還本、政府還息以及大學還本、政府部分貼息幾種。
地方政府的盤算是，大學向銀行貸款建設，替當地政府解決教育經費投入不足，也帶來經濟增長效益和促成當地房地產市場榮景。於是，在地方政府鼓勵和引導下，許多大學直接向銀行大量貸款，擴張操場、教學樓、辦公樓乃至圈地。
長期以來，身負重債的各大學，並沒有放慢貸款的步伐，銀行也沒有拒絕貸款。原因在於，大學不像企業，沒有財務報表，無法作信貸風險評估。
銀行認為，大學有政府部門當靠山，沒有太大風險，因此，競相與大學簽訂"合作協議"，把錢借給已是債務纍纍的學校。
原本估算應是地方政府、大學和銀行"三贏"局面，卻因各大學高估自身能力，舉債過多，龐大的債務和可能引爆的大學破產潮，成為三方難以解決的燙手山芋。
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