陳水扁星期天（1月13日）是在參加海外臺灣人社團公共事務協會(FAPA) 二十週年慶祝大會時，宣布他已於星期五批準外交部長田弘茂送給他的公文，確定臺灣民眾所使用的「中華民國」護照，將加註「Taiwan(臺灣)」英文字樣。
海外臺灣人公共事務會(FAPA)是具有台獨色彩的組織，陳水扁在大會上幾乎全程使用臺灣方言（閩南語）。
陳水扁並說，這是他送給FAPA二十週年最重要的禮物，也是大家期待很久、努力很久，是多數臺灣人的願望。
據BBC報導，陳水扁也表示，「我們的護照過去都一直被人誤會是中華人民共和國的護照，讓我們很沒面子，也沒尊嚴，不能說是這本還是那本護照都搞不清楚。自己搞清楚了，但外國政府搞不清楚，外國人搞不清楚。」
當陳水扁宣布護照將加註臺灣字樣後，來自美國和臺灣的數百名FAPA會員起立鼓掌歡呼，陳水扁也在大會上高喊「臺灣加油」。
陳水扁這項宣布引發臺灣在野黨反彈。國民黨政策會副執行長兼大陸事務部主任張榮恭表示，民進黨政府說護照加註臺灣，是要區隔中華民國與中華人民共和國，但可能會造成國際上認為臺灣是中華人民共和國的一部分的「反效果」。
親民黨主席宋楚瑜表示，此舉將損及國家體制、尊嚴與國格，他呼籲總統陳水扁應恪遵憲法。
新黨人士則指，陳水扁不但是言論支持台獨，更已以行動支持台獨，此舉是不顧臺灣安危，將害死臺灣。
此外，親民黨和新黨立法院黨團負責人批評，陳水扁這是以意識形態執政，「國號」問題並非執政當局要怎麼做就可以怎麼做。
在野黨並揚言，將在立法院院會中，刪除外交部新台幣一億元預算，也將決議不得變更護照封面「國號」，讓陳水扁批准了也不能實行。
至於「Taiwan 」英文字樣是加註在護照的封面上，或是其他地方，臺灣外交部星期天低調表示，目前正就如何加註等細節進行研究。
外交部預定從今年11月起全面換新現有護照，相關措施還須配合推出新版護照後才會實施。
臺灣外交部並強調，護照上加註臺灣「Taiwan 」字樣，是為了方便臺灣民眾旅遊時不被誤認為來自中國大陸，並非是要更改中華民國「國號」。
