☉ 水庫庫底清理
大壩建成後水庫蓄水，要淹沒農田、森林和居住區等，為了防止水庫水質污染、保證庫區航道的安全，以及水庫水域的利用（水產、旅遊、水上運動等），必須對水庫庫底進行清理。中國水利部的水庫庫底清理要求，第一是林木及農作物的清理，淹沒區裡的樹林、灌木、農作物等，均要砍伐並運出淹沒區；第二是建築物的清理，淹沒區裡的建築物及附屬設備原則上要拆除，清除有困難的，要在地圖上註明位置及高度，礦井、人防工程等要採取填塞和封閉措施，露天礦要採取覆蓋、封閉措施，掩埋屍體１５年以內的墳墓，要遷出淹沒區；第三是衛生清理，廁所、糞坑、牲畜圈欄、垃圾堆地、污染物堆放等地的污染物要運出淹沒區處理，原址要按衛生部的規定進行處理，遷移後的墳墓也要進行衛生清理。
國外水庫庫底清理，強調淹沒區裡的樹林、灌木、農作物等清除和淹沒區裡的有害物質的清除，以及衛生清理，並沒有規定要清除、炸毀淹沒區裡的磚石建築物，只要它們不妨礙未來庫區的水路航運。建築物中需要清楚的是在水底會腐爛的木結構物如房屋的頂架、門窗，因為磚石建築物對水質沒有影響，況且將來會被水庫中的泥沙所淹沒。另外，國外水庫的庫底清理必須在移民工作完成之後、水庫開始蓄水之前進行。但是水庫清理工作的規劃，則必須在工程論證同時上報、同時審批，水庫清理工作的實施方案則應該和水庫大壩工程建設設計報告同時審批。
但是在１９９２年４月全國人民代表大會審批興建三峽工程提案時，在論證報告中並沒有水庫清理規劃，在１９９３年國務院三峽建設委員會審批三峽大壩初步設計時以及制定移民大綱時，還是沒有水庫清理方案，直到１９９７年１２月，三峽建設委員會才制定出《長江三峽水庫庫底衛生防疫清理技術方案》。２００１年３月２日，全國政協召開九屆四次會議上，全國政協代表韋思琪提出一份關於三峽水庫清理的提案，要求根據《環境保護法》和國家水利電力部１９８６年頒布的《水庫庫底清理辦法》規定，必須在蓄水前３個月完成庫底清理，驗收合格後才能蓄水使用。也就是說，三峽清庫工作必須在２００３年２月結束，有效時間不到兩年！韋思琪代表懇請國務院及國家三峽建設委員會對三峽庫區清庫工作給予關注和大力支持。
直到２００１年第四季度，國務院三峽建設委員會才作出決定，三峽水庫將於２００３年６月１日發電，國家要求庫區於２００２年１２月底以前完成移民搬遷和庫底清理。三峽庫區清庫將按嚴格的標準進行庫區內單位、企業、移民個人房屋全部拆除、林木全部實行齊地砍伐運出庫外、埋葬１５年以內的墳墓全部搬遷出庫外併進行消毒，１７５米以下的電力、電訊、廣播桿線以及橋樑等構筑物污染源、污染物全部拆除並由衛生防疫部門進行嚴格消毒，清庫後地面將不留任何障礙物。
國務院三峽建設委員會規定的特點是，全部、乾淨、徹底地拆除和外遷，全面、嚴格地進行消毒，清庫後地面將不留任何障礙物，實行一個真正的「三光」政策。庫底清理工作的時間是一年，到２００２年１２月底完成，其決心之大之堅決，大概連韋思琪代表也沒有想到。
☉ 庫底墳墓４萬多座
那麼三峽水庫庫底清理工作量到底有多大呢？
１、林地１３萬畝，農田３０余萬畝，其上的樹木、莊稼等植被必須齊地砍伐運出淹沒區，然後進行處理；
２、需要拆除建築物總面積約３千萬平方米，其他建築物如大中橋樑１１１座、水電站９０座、抽水站１３３座；
３、城鎮污水管道中的淤泥需要清除，掏出曬乾或運出庫外消毒，污水管道須封閉；
４、３００萬噸垃圾外遷，其中含１４００噸以上的重金屬等污染物；另外的３８萬平方米垃圾場地需要做衛生處理；
５、５５００萬噸工業固體廢物必須遷出淹沒區，其中百分之五為危險物；
６、公共廁所約３０萬平方米、醫院及獸醫站１９６７座、屠宰場１５００個、有毒物質場地７０３處，放射源５９個；
７、墳墓４萬多座。
就這些清理工作量而論，又為三峽工程增添好幾個世界第一：垃圾搬遷量第一、搬遷墳墓數量第一……。
國務院三峽建設委員會為水庫庫底清理工作共撥出資金９２７８萬元。但根據作者的分析，這個庫底清理工作根本無法完成。這裡僅拿垃圾和工業廢物的處理來分析：
首先，三峽地區沒有容納３００萬噸垃圾和５５００萬噸工業固體廢物的土地。三峽工程第二期５０萬移民中，已經有１２萬農村移民因為土地不足，而被迫遠遷，哪裡還有土地來容納搬遷出來的垃圾和工業廢物？
其次，這近一億的投資，面對這堆積如山的垃圾，是少得可憐。如果把全部資金投入垃圾搬遷，每噸垃圾運輸費僅為３０元；如果把全部資金投入工業廢物的處理，每噸廢物處理費不到２元。
再則，一年時間內根本無法完成這３００萬噸垃圾和５５００萬噸工業廢物的搬遷和處理，特別是無法完成對重金屬等污染物和危險工業廢物的處理。
這９２７８萬元投資，僅用來炸毀３千萬平方米的建築物，就另當別論了。
☉ 淹沒區可能有炭疽病屍體！
三峽淹沒區內有４萬餘座墳墓需要搬遷處理。對中國人來說，陰宅和陽宅一樣重要，搬遷這４萬餘座墳墓的難度，不比搬遷４萬個移民容易。因此國家規定對墳墓的屍體和遺骨就地火化，平毀墳墓，然後作衛生處理，這樣可以節省時間和費用，但必然遭到墓主親屬的極大反對。
特別要指出的是，三峽淹沒區的墳墓中可能有炭疽病的屍體，１９９７年１２月三峽建設委員會和衛生部制定出《長江三峽水庫庫底衛生防疫清理技術方案》中，特別對炭疽病屍體的處理，作出了具體的規定：「埋葬１５年以內的墳墓，要將屍體一一挖出運至庫外焚燒；屍體挖出後，坑穴及周圍髒土要反覆攤晒並用漂白粉消毒後用淨土填實；因炭疽病死亡的屍體（包括人、畜）不得遷出庫外，就地起屍焚燒或用焚燒爐焚燒。」到底三峽淹沒區的墳墓中有多少炭疽病的屍體，它們具體分布在哪裡，三峽建設委員會沒有提供詳細的資料。但是他們制定這一特別措施，肯定事出有因。
９１１事件發生之後，美國發生多起郵寄炭疽病病菌事件，可以說是談「炭疽病」而色變，社會正常生活受到極大衝擊。因此，三峽淹沒區內炭疽病屍體的處理，必須慎之又慎，任何疏忽都會引起社會災變。
除了炭疽病外，就數這垃圾中的１４００噸以上的重金屬污染物的危害嚴重。根據環境衛生科研單位的抽樣分析表明，在三峽庫區垃圾中的有機質含量在２％至１２％之間，鉛、砷等重金屬含量約在０．０５％至０．７之間，如果這些重金屬污染物或其滲濾液進入三峽水庫，有機物的超標，將使三峽水庫的水質變黑，失去作為飲用水的功能，其影響將會超過百年。
根據作者在三峽地區工作時的經驗，三峽水庫庫底清理工作的困難還在於淹沒區內有許多小煤礦、小硫磺礦和小磷礦，要封閉這些小礦井是十分困難的。有的磷礦是露天挖掘，要封閉開挖的工作面更是困難。當庫水淹沒了這些礦井後，煤礦、磷礦、硫鐵礦中的有害物質溶於水中，長期危害水體。三峽地區的工廠中，有污染和劇毒污染的工廠為多，如碳黑廠、鐵合金廠、化肥廠、化工廠、電池廠等等，這些工廠建築物和設備被炸毀之後，也必須搬運出水庫淹沒區，才能減輕將來對水庫水質的影響，而這些工作是在一年的時間之內根本無法完成的。
☉ 房子是移民的最後防線
人們也許還記得在兩個月前在雲南發生的悲劇，在２００１年１０月３０日中午１時４３分，宣威發電廠１２０米高的大煙囪在定向爆炸之後倒塌，然後又來了個「鯉魚打挺」，反彈起來的大小水泥塊砸向２００米外的密集人群，多人被打中，數十人受傷，一人不治身亡。「西南第一爆」變成「西南第一噩夢」。為什麼三峽工程清庫第一爆，要選擇在三峽工程移民工作正在進行之中、移民大部尚未遷出的地區？為什麼要選擇人口集中的奉節縣城？為什麼要選擇在星期日下午，縣城中心顧客和遊人最多的時候？是為了保證爆炸的安全？是為了爆炸的效果？還是為了減少清庫爆炸的成本？
中國的新聞媒介說，三峽工程清庫第一爆標誌著三峽庫區由大動員轉入大搬遷、大拆除，拉開了庫區大規模清庫的帷幕，顯示了三峽工程移民新生活的開開始，說明瞭中國政政府完全有能力搬遷安置好三峽庫區的百萬移民。
但是，「這一爆」另有目的。在這之前，三峽工程就多次利用炸藥炸毀移民的建築物，害怕移民在遷移之後，再重返故居，作者手中就有多張照片，記錄了在１月２０日之前炸毀移民建築物的事實；而且，永安鎮政府辦公大樓是鋼筋混凝土結構的建築物，水庫蓄水後不妨礙長江航運，也沒有炸毀的必要性。
按照三峽工程移民計畫，２００２年底必須完成５０萬移民的任務。到２００１年底，有近４０萬人在移民搬遷合同書上簽了字，還有１０萬餘人尚未簽字，他們也不知道要被遷往何處。在已經簽了字的近４０萬人中，絕大多數人還住在要拆遷的房屋中，也不準備離開，因為他們對移民賠償費和安置處理還有不同意見。
他們為什麼要在搬遷合同書上簽字？可以說這是「政治大動員」的結果，善良的人們也許不知道三峽工程又是使用了什麼樣的辦法迫使他們簽的字，人們一定還記得文化大革命中是如何動員知識青年上山下鄉的吧？三峽工程移民用的是同樣的方法！而且還有改革和創新，三五個負責移民的幹部整天泡在一個移民家中，喋喋不休地宣傳三峽工程的偉大意義，宣講移民要為國家做貢獻的道理，只要移民一天不在合同書上簽字，這些移民幹部保證明天還來，移民沒有淥
