周正毅涉及的違規超貸、逃稅及股市非法操作等問題，根據大陸媒體的報導，與中國銀行香港分行總裁劉金寶的突然去職有關，目前中共中央紀律檢查委員會、國務院銀行監督管理委員會及監察部組成的聯合調查小組，正對此案密集調查中。
業界認為，周正毅當年在抵押不足的情況下，從中國銀行上海分行取得二十億元人民幣貸款，用於入主上市公司「建聯通」（即「上海地產」），極不尋常，而劉金寶時任中國銀行上海分行的行長。
《法新社》自上海報導，目前任教於香港中文大學的中共政治觀察家吳國光認為，周正毅並不是中共高層黨員，中共中央紀律檢查委員會派員前往上海調查此案，是有中共高層涉入此案的一個明顯訊號。
法國當代中國研究中心主任高敬文（Jean-Pierre Cabestan）更進一步指出：此案「一定是黨內高層同意擴大調查，而調查觸及的高層領導人甚至可能包含江澤民」。
廈門大學政治與行政學系教授朱仁顯則表示，在大陸目前這種由計畫經濟過渡到市場經濟的階段，很難避免官商勾結的問題。
另據《亞洲週刊》報導，周正毅事件在上海政壇及商界引起震湯，目前周正毅已經供出包括地產商、金融及房地產官員二十餘人涉案，其中甚至包括一名上海市人大副主任。此外，牽涉的貸款銀行，除了已知的中國銀行外，還包括建設銀行、交通銀行、工商銀行等十多家銀行在上海的分行。
據指出，此案的調查，得到中共前任總書記、現任軍委主席江澤民的同意，案件更被定性為「建國以來最大的金融詐騙疑案」。此外，中共高層日前已向中紀委和監察部發布對此案要「一查到底」的指示。
關於中共政治局委員黃菊與此案的關係，美國《紐約時報》先前即指出，此案可能為黃菊的政治前途「投下陰影」，但當日大陸媒體就出現一則新聞簡訊稱，黃菊在中南海會見了外國企業領袖，藉此顯示黃菊仍未受此案牽連。
另有北京政治觀察家認為，在大陸各地都出現眾多貪官污吏的情況下，上海反常地處於「唯我獨清」的地位，而江澤民當年以「反腐敗」的手段，將以政治局委員陳希同為首的「北京幫」拉下馬，周正毅一案，因此可能與中共新領導層企圖掀開上海腐敗的蓋子有關。
