香港明報27日報導，中紀委在 1999年 12月對外公布孫的違紀行為包括：擔任高院院長期間，走私進口兩輛汽車，共逃稅 63.7萬元（人民幣，下同）；兩次購買、交換乘坐超標準汽車（內地官員按級別規定座駕的等級）；擔任昆明市中院院長期間，隱瞞訴訟費收入 7743萬元，並用其中的930多萬元給職工發獎金和福利。
中紀委當時指「這是一宗領導幹部有令不行、有禁不止、頂風違紀的典型」，又指孫小虹「個人主義膨脹，貪圖享受，狂妄自大」、「毫無顧忌地違紀違法」、「性質惡劣，影響極壞」。
中紀委報經中共中央批准，決定撤銷孫的黨內一切職務，並建議雲南省人大常委會撤換其雲南省高級人民法院院長職務、罷免其雲南省第9屆人大代表職務，但案件未提司法檢控。
明報報導說，孫小虹在沉寂一段時間之後， 2000年下半年又獲安排出任半官方機構雲南省貿促會會長，同時獲送往中共中央黨校學習。資料顯示，在貿促會的就任大會上，孫小虹謙虛地說：「我在法院工作二十餘年，雖然通過審判工作對經濟有所瞭解，但接觸十分有限，外經貿工作對我而言是一個全新領域。」
2001年，孫小虹又獲安排為省外經貿廳副廳長，之後提拔為常務副廳長，主持工作。今年 1月，他正式獲任命為省外經貿廳廳長，並兼任第11屆昆明出口商品交易會組委會秘書長。
據悉，孫小虹出身高幹家庭，其父孫雨亭是雲南的「老領導」，門生遍佈全省， 50年代即擔任中共雲南省委常委、組織部部長，之後曾任雲南省委副書記，雲南省人大常委會黨組書記、副主任， 2001年 5月逝世，享年 91歲。
違紀官員再獲重用在內地並非個別現象。 2001年底，南京市一些官員在寧波醉酒尋歡大鬧夜總會，經媒體披露後被撤職。事件主角之一的南京市自來水公司副總經理趙夢龍，去年初即獲提拔為總經理。南京當局解釋，「趙夢龍在受處分超過了一年後，主管部門依據民主推薦，嚴格按照幹部任用程式，任命其擔任總經理」。
