北京人士指出，香港政界出現「台獨」蹤影，給「一國兩制」構成了嚴峻挑戰，尤其是香港社會正處於轉型時期，任何政治風波都有可能造成危亂。中央高層領導針對該事件明確指示要一查到底，應該重新整頓港島政治秩序，嚴明制度管束。北京高層最近幾次內部講話，表示絕不允許香港成為分裂中國的基地。
處心積慮影響香港政治
在《基本法》實施之後，香港政治環境尚沒有惡化到直接挑戰國家主權尊嚴的地步，此番「台獨」風波無疑是開了先河。北京擔心如果這次風波沒得到有效控制，臺灣及香港的「台獨」勢力會進一步活動，香港會被臺灣利用。北京人士認為，劉慧卿直接站到了「台獨」一邊，公然為「台獨」分子張目，其所作所為，已經超出了現代民主政治的基本底線，觸犯了中華人民共和國憲法和香港特別行政區《基本法》，應該引起包括香港市民在內的所有中國人的高度警惕。
依照中華人民共和國憲法，臺灣是中華人民共和國的神聖領土的一部分。完成統一祖國的大業是全中國人民的神聖職責。作為中華人民共和國香港特別行政區的立法會議員，理應瞭解憲法的基本規定，理解中央政府對臺灣問題的一貫立場，遵守憲法的規定，利用自己的社會影響宣傳憲法。但是，劉慧卿顯然在玩火，自己的前途暫不說，拿國家的前途在開玩笑，這其實也等於在出賣國家利益。
北京認為，劉慧卿在臺灣的講話，已不是言論自由的問題，因為她是香港立法會的議員，不是一般的人物。
北京人士認為，臺灣島上的「台獨」勢力對於香港社會實行「一國兩制」歷來持反對立場，目前香港與中國內地關係的日益緊密也給「台獨」勢力造成了心理威懾。因為，「台獨」勢力明白只要「一國兩制」成功運行，兩岸統一的可能性就存在，並且具備現實意義上的參照模式。當然，「台獨」勢力是不願意看到這種局面出現的，只有想方設法干預香港政治生態環境的建設，從中培養內部力量演繹《特洛伊木馬神話》，才能夠達到影響整個香港政治傾向之目的。從另一方面看，北京一直不想香港成為一個政治城市，而只是一個經濟城市，最近香港社會過分政治化使得北京非常擔心。
北京人士指出，這次香港「台獨」風波並不能簡單看待，結合將要進行的臺灣大選政情，事件的炮製似乎存在配合「台獨」勢力左右大選局勢的嫌疑。
北京經過臺灣的幾次大選，已充分認識到每到選舉之時，總有一些「台獨」分子挑起事端，以所謂的族群分化和兩岸分裂作為自己的政治主張，並以此達到激化矛盾，破壞共識的政治目的。而每次選舉，臺灣的「台獨」勢力都將北京拖入其中，以達到自己的目的。但是，臺灣民眾也並不全是擁護公投主張的，因為他們也害怕中國大陸的武力收復，也對「台獨」主張的正確性心存疑問。所以，從自身利益出發，臺灣民眾的最終選擇並不一定就是「台獨」選擇。
內地網站群起而攻
作為香港特別行政區立法會議員的劉慧卿，不從維護國家統一出發而積極宣傳一國兩制已經不對，相反她卻是加入到「台獨」行列中來詆毀國家統一，其言行必然遭到中港兩地政治力量的譴責與排斥。劉慧卿在政治智慧方面的缺陷明顯，也不適合生存於香港的政治圈中，因為即使香港政治界不處理她，中央政府也會出面平息。目前。中國大陸的網站進行的調查顯示，劉慧卿已成為中國最令人討厭的人。
北京人士強調，在二十叁條正式出臺之前，劉慧卿的言論正在提醒香港社會，任何損害國家重大利益的言行都將被視為危險信號。香港社會的穩定在於人心，而不是國家機器的壓力，順應人心的二十叁條才可能受到香港社會的尊重。因此，高層制訂二十叁條的用意要落實到維護港人切身利益上，在高度自治與中央支持之間放置一個平衡器，不能給「台獨」勢力以任何口實來攻擊「一國兩制」。香港社會的持續繁榮不僅是經濟上的成功，也是政治民生狀況的漸進改良，利用「一國兩制」的成就來回應臺灣民眾將比「文攻武鬥」更犀利，更見成效。
