即將實施的新條例是美國《反生物恐怖法案》BTA的配套法規。BTA是美國國會在2001年美國遭炭疽襲擊後通過的，2002年6月美國總統布希簽署了這一法案，使之成為正式法律。該法案授權撥款430億美元用於購買疫苗、改善食品檢查和加強供水系統的安全。
根據《食品企業註冊管理條例》，美國本土和對美出口的外國食品及飼料生產、加工、包裝、倉儲企業必須在FDA進行登記註冊，未登記的外國食品及飼料將在入境港口遭到扣留。FDA自10月16日開始受理註冊。
按照《進出口食品預先通報條例》，FDA要求進口食品及飼料要在到達前5日內用電子方式接收並確認申報相關的信息。
通過對FDA食品註冊通報制度的政策解讀，權威人士指出，有關「美國代理」的規定最為棘手。據規定，任何向FDA登記的機構，必須指定一個美國代理，該代理須在美國居住，有營業地點，並實際在美國境內，還將擔任FDA的緊急情況聯繫人。
另外，美國的食品註冊通報制度涉及除肉類、家禽和蛋類產品外的所有食品，也就是說，中國目前向美出口的絕大多數食品都包括在內。
中國食品土畜進出口商會綜合業務部主任沙奕杭擔心，不少企業將因為交納不起代理費用和找不到合適的代理商，而無法對美出口。
相關資料表明，美國是世界第一大農產品進口國，也是中國農產品出口的第4大市場，中國去年對美出口農產品16．3億美元。
國家質檢總局中國商檢研究所北京陸橋質檢認證中心副主任李莉介紹說，根據新條例，美國FDA預計全世界將有40萬家企業在兩個月內註冊，中國認監委估算，需要註冊的中國企業數量大約有1萬家。而福建海峽檢驗認證有限公司錢鴻萍則估計，包括明年以後需要輸美的企業和涉及到的物流企業，可能有兩三萬家。
國家認監委註冊管理部顧紹平11月上旬表示：「形勢很嚴峻，註冊的企業並不多。很多企業對此並不重視，有的企業甚至持觀望態度，寄希望於法規不會如期執行。」
對此，國家質量監督檢驗檢疫總局徐學林認為：「一方面，很多企業本身跟不上形勢，對於網上辦公還不熟悉；另一方面，企業信息渠道不通暢，對12月12日之前不註冊的負面效應瞭解不夠。」而某些已經註冊的企業填寫的信息可能並不真實，或者有矛盾之處。「這就可能給以後埋下隱患。根據法規規定，企業的記錄將會一直保留。一家企業的不實信息，可能影響到中國整個產業」。
美國的新條例也讓中國的食品出口大省們感到不安。
據江蘇媒體報導，江蘇向美國出口食品的企業有140多家，年出口額在2億美元左右，這當中以小龍蝦為最多。目前蘇北鹽城、淮安等地的小龍蝦出口企業正在忙著註冊，有不少小規模企業因為缺少懂英語的人才，連登錄網站的內容都看不懂，只能求助於有關專業機構。
湖南省是農業大省，對美國出口的食品、飼料生產企業有30餘家。據報導，湖南省外貿廳有關人士表示，FDA發布的這兩項法規對全省農產品、食品、飼料生產及加工、包裝、倉儲和出口等相關企業以及外貿公司影響極大。
