針對部分政治人物對於該調查報告一再繞著「非政治謀殺」的說法加以解讀，盧仁發以三一九槍擊案專案小組召集人的身份強調，司法偵查不應受到政治的干擾，在偵查未結束前不要兀下結論，請政治人物還給專案人員純淨的辦案空間。
至於李昌鈺博士鑒識團隊的調查報告對此案的影響，盧仁發和刑事局長侯友宜都給予正面評價，兩人均認為，這份調查報告的結果和建議除肯定國內刑事鑒識水準外，也確定檢警辦案方向正確，肯定辦案人員的努力及增強辦案信心。
旅美鑒識專家李昌鈺博士做的三一九槍擊案鑒識報告，昨日上午十一時交給盧仁發，盧仁發召集相關檢警召開記者會說明。
盧仁髮指出，該鑒識報告證實，陳總統的傷是遭非制式槍彈打傷，以今年國內發生迄今的四起槍擊案可以發現，即使非制式槍彈，即俗稱的土改造槍彈，其殺傷力也相當大，甚至會造成死亡。
侯友宜表示，從李昌鈺的報告內容可以看出，相關物證的結論與偵查動機之間，並無直接關連，報告目的是為偵查人員提供辦案方向，而李昌鈺報告的建議，與目前檢警調查方向幾乎一致，則給檢警更明確的方向感。
盧仁髮指出，鑒識是鑒識，偵辦是偵辦，在李昌鈺的調查報告中完全未提到動機或「非政治謀殺」等字眼，甚至未提「政治」、「謀殺」等字眼，因為「動機不是鑒識的範圍」。
侯友宜表示，調查報告從銅、鉛兩彈頭的基座等處的擦、刮痕，鑒驗出具有其高度類似性、一致性的特性，推論出是「同一槍管發射」，也和專案小組研判「一人一槍連開兩彈」的可能性較高吻合，頗具偵辦參考價值。
〔自由時報記者蘇永耀臺北報導〕鑒識專家李昌鈺完成「三一九槍擊案調查報告」，行政院發言人陳其邁昨日表示，行政院尊重李博士的鑒識結果，至於在野黨過去以來多次召開記者會，質疑槍擊案件的真實性，隨著調查報告的出爐，該等不實謠言亦將不攻自破。
陳其邁強調，在不影響案情偵辦前提下，將考慮把報告公開；尤其報告並無提及任何「政治謀殺」字眼，在野黨應給予專業人員獨立辦案空間，如以政治力介入，並無益於事實釐清與司法偵查，更不該一錯再錯地堅持既違憲違法，且政黨利益凌駕專業辦案的「三一九槍擊事件真相調查特別委員會條例」。
〔自由時報記者田世昊臺北報導〕檢察總長盧仁發昨天說明鑒識專家李昌鈺完成的三一九槍擊案調查報告內容，國民黨立法院黨團對此表示，專案小組未能有效偵查辦案，唯有成立專責專權真調會，才有利刑事偵查；親民黨立法院黨團認為，盧仁發在離職前開記者會，內容毫無新意，只是對三一九槍擊案「草草交代了事」。
國民黨團書記長黃德福指出，李昌鈺已說明數次三一九槍擊案不是政治謀殺，從子彈的火藥填充、使用非制式手槍等都可知道，刑事局在這方面不必花心思解釋。
他說，李昌鈺研判三一九槍擊案不是政治謀殺，泛綠陣營所謂國親聯合中國暗殺陳水扁總統的說法「不攻自破」，他表示，專案小組至今都未有任何進展，就是因為層級太低及事權分散，必須成立專責專權的真調會，才能作最有效的刑事偵查。
親民黨立法院黨團總召集人劉文雄則呼籲警方盡速公布李昌鈺完成的「三一九槍擊鑒識報告」中文版及英文版，以及刑事局所做的相關鑒識報告，讓民眾得以在網站上瞭解詳情，黨團也會將周錫瑋及國民黨所做的鑒識報告刊載於網站上，讓民眾比較。
