陳水扁總統這次訪問教廷與義大利，與梵蒂岡交涉的主導者是臺灣駐教廷杜筑生大使，在取得教廷同意後，接下來的入境簽證問題，重擔則落在臺灣駐義林基正代表的肩上，而這場外交戰雖然只有短短不到四十八小時，過程卻是高潮迭起。
臺灣駐教廷與義大利館處在義大利時間4月6日獲得臺北訓示陳水扁總統將親來弔唁教宗後，林基正開始與義方聯繫，教廷外交部歡迎到訪是交涉的重要依據，但中方的「反制」幾乎也同步展開。
回顧中國的攻防，共分為三部曲，第一階段是不准陳水扁總統到訪；但無法順遂後隨即進入第二階段，即另一具有國家重要象徵意義的外交部長陳唐山不准陪同前來，企圖降低官方色彩，使總統即使到達也成為私人的非正式訪問；在仍難以如願後，中方改為施壓陳水扁總統一行不可以搭乘專機，必須改搭乘正常航班前往義大利。
面對中國百般「去主權化」，臺灣前線人員的應對也綿密進行，對於對岸不讓陳水扁總統親自帶團，義大利外交部發言人在7日中午的宣布，最能透露個中三昧，他說：「關於義大利政府發給臺灣的陳總統一行來義簽證，是基於國際條約的慣例，拉特朗條約規定，梵蒂岡邀請的貴賓，義大利有義務給予簽證。」
拉特朗條約是在一九二九年訂定，之後已經過多次修正，義大利拿出這紙條約做為擋箭牌，表面上冠冕堂皇，實質用意則在向中國強調，邀請的人是教廷，義大利不得不配合辦理，而這也是臺灣在遊說時的關鍵。
此外，最值得注意的是，義大利官方特別稱「臺灣的陳總統」，則讓代表處格外的興奮。
同樣的，對岸擋不住陳水扁總統、改擋陳外長的部分， 臺灣則在提列給教廷參加追思彌撒的名單中，已經把陳唐山列入，使之成為教廷的正式賓客。
這次，梵蒂岡給臺灣五個名額，與美國完全相同。臺灣分別是總統、外長與三位教長。美國團即因布希、老布希、克林頓都要前來，致使卡特前總統被擠出代表團之列，不高興的卡特還曾發表聲明表達「遺憾」，可見臺灣所受待遇確實與各國平等。
既然陳唐山也是教廷的客人，義大利無由否決教廷的決定，對岸的第二階段打壓當然也失敗。不過，中國並不因此放棄，他們的駐義大使甚至想「搞飛機」。
陳水扁總統搭乘專機前來義大利，是林基正的一大挑戰，因為這次全世界為了追思教宗，共有一百五十多國元首與特使、兩百多個弔唁團集中於幾天內來到梵蒂岡，羅馬機場的接待是義大利的沈重負荷，中方以此攻堅有其政治目的，但頗能對準義方的弱點下手。
因此臺灣代表處的防守更加要滴水不漏。這段期間，臺灣與義大利外交部持續進行熱線聯繫，直到陳水扁總統的專機在義時間7日上午九點四十五分於中正機場起飛了，此地仍不敢掉以輕心。
果然，7日當天林基正與義外交部多次通電話中，獲知中國的大使一直待在外交部不走，堅持義方要給個交代，即使專機已經起飛，也要讓陳水扁總統無法直接降落。
這位中國大使3月才剛上任，面對此一「困局」，當然使出渾身解數；尤其義大利總統、總理才陸續訪問中國，3月14日通過反分裂法後，中國18日就到義大利等歐盟國家來解釋說明，中義關係並非冷淡。
也許，中國在情急之下，日前由外交部發言人秦剛出面抨擊「不准義大利政府下次再有這樣的情況」，足見其擔心國際骨牌效應的憤怒；不過，如此措辭在義大利方面引起不佳的感受，一位人士私下就說，如果中國基於內部需要，事後罵一罵可以理解，但是由外交部公開講話，未免太不尊重義大利。
陳水扁總統抵達臺灣後，義大利報紙仍在報導這次臺灣總統的首次到訪事件與影響，「臺灣出席、中國缺席」、「臺灣造訪、中國抗議」的論述基調迴盪在此間，臺灣被提上枱面討論，從未有如此盛大局面！
