十月十三日晚，國務院召開國務會議。溫家寶在會上宣布暫停港股直通車業務。
溫家寶宣布港股直通車業務暫停
十月十三日晚，國務院召開國務會議，有關部門，包括髮改委、財政部、央行、銀監委、外匯管理局、中銀，都被通知到會。
會上，溫家寶宣布：經多方調研、評估，並報請中央政治局研究，決定暫停港股直通車業務。
有關決定的五點
有 關決定有五點：（一）八月二十日，國家外匯管理局宣布：開放內地居民用外匯或人民幣在天津濱海新區，通過中國銀行天津分行購買外匯或香港股票，是草率的， 影響面是大的，國務院要承擔一定責任；（二）被稱為「港股直通車」的業務，是一項金融券、證券業重大的改革措施，要進行科學、有規則的評估、研究；（三） 對港股直通車業務在實施前，必須充分就內部、外部各種風險作出評估，預防措施和針對政策要落實；（四）對港股直通車業務，要制訂監管操作方案，報送審核； （五）港股直通車業務實施時間表、有關規則、辦理機構等，經國務院審核後，由有關部門統一向外發布。
溫家寶又一次自我檢查
溫家寶在會上又一次作了自我檢查，稱：這次就開放內地居民購買外匯及香港股票業務，尚未啓動，已經付出某種代價，反映出對經濟、金融工作的指導思想還不能擺脫「大干快上」、「先破後立」違反科學的思維。中央作出暫停決定，是求真務實、落實科學發展觀的體現。
溫說：作為總理，是要承擔主要責任的，要從多方面來總結。對可能出現風險，及風險危害程度、市民承受力，都要有充分估計，以避免金融秩序混亂、資金外流失控、證券市場大幅波動，以及來自國際金融炒家的影響等。
溫家寶對有關部門的指責
溫家寶又指責從事件中反映出很值得注意的傾向，如：多中心，各自為政向外發布消息、作出承諾；又各自對外表示要參與業務，各自作出不同解釋，被視為中央的決策。
會上決定統一對外口徑
會上決定：發改委、財政部、央行、銀監委、證監委、保監委，就境內居民境外投資，暫定統一對外口徑：（一）經濟、金融改革發展是中央的方針、政策，不會改變，不會倒退；（二）有關金融改革非常重大，非常複雜，需要一個具體操作方案，需要一定時間。
會上披露震驚性內情
會上披露了震驚性的內情：從八月二十日，國家外匯管理局宣布開放內地居民境外投資後，至十月十一日，內地資金外流到香港證券市場五千多億元，還不包括通過非正常的途徑和地下錢莊外流資金。
據 國務院研究室、央行研究室調研評估：一個多月，內地資金外流一萬億，其中屬官方和國企中資，佔百分之七十五至百分之八十。至十月中旬，資金外流已達到三萬 億到四萬億，其中百分之六十至百分之七十，經香港流向歐洲、美國。內地金融秩序會發生震盪性混亂，包括恐慌性擠提、拋售人民幣爭購美元、歐元。人民幣發行 量將失控導致大幅貶值等。
港股直通車出臺經過
八月十日，發改委、央行向國務院提交《關於金融發展、改革若干試 行建議方案》，其內容為：（一）八月下旬，在天津試行開放內地居民用外匯或人民幣，通過中國銀行天津分行，購買外匯或香港股票，十月中旬擴大到其他土要城 市；（二）十二月中旬或二００八年一月，開放內地居民用外匯或人民幣，通過國有商業銀行購買外匯、外國證券、股票；（三）十二月起，放寬內地居民兌換美元 或等值國際貨幣二十萬美元；（四）和國際主要貨幣面值、流通等方面銜接，二００八年一月，發行人民幣五百元大鈔；（五）如條件基本成熟，二００八年七月一 日起，人民幣對外自由兌換，是近期最好時機。
對此，溫家寶召開專家會議，至少研究了六次。溫說：對各種風險評估要有前瞻，要有國際形勢變幻莫測應對。溫又強調：我主張要等、要看、要多研究，要多做好當前事，不要搞冒進。
