注意飲水和飲食衛生是預防腸道傳染病的關鍵。保護水源，特別是生活飲用水，免受污染。用漂白粉或漂白粉精片（淨水片）消毒生活飲用水。注意飲食衛生。不喝生水，飯前便後洗手，不吃腐敗變質或受潮霉變的食品，不吃死亡的禽畜，不用髒水漱口或洗瓜果蔬菜，碗筷應煮沸或用消毒劑消毒，刀、砧板、抹布也應嚴格消毒，生熟食品應該分開存放，水產品和海鮮食物要煮熟煮透再吃。注意環境衛生，消滅蚊蠅。不隨地大小便，糞坑中加藥殺蛆，動物屍體要深埋，有條件的可加放生石灰消毒，土層要夯實。要及時消除垃圾、污物、環境消毒、管理好糞便、垃圾。
蟲媒傳染病預防
預防流行性乙型腦炎、瘧疾、黑熱病等蟲媒傳染病，應採取滅蚊、防蚊和預防接種為主的綜合措施。實行24h值班和疫情網路零報告制度，控制和管理傳染源，家畜家禽圈棚要經常灑滅蚊藥，病人要隔離。清掃衛生死角，疏通下水道，噴灑消毒殺蟲藥水，消除蚊蟲孳生地，降低蚊蟲密度，切斷傳播途徑。做好個人防護，避免被蚊蟲叮咬，夜間睡覺挂蚊帳，露宿或夜間野外勞動時，暴露的皮膚應塗抹防蚊油，或者使用驅蚊藥。根據疫情監測動態，及時給易感人群接種乙腦疫苗，同時做好斯銻黑克、噴他脒、乙胺嘧啶、伯氨喹等緊缺藥物的儲備，一旦發生黑熱病和瘧疾方可有效治療。
人畜共患病和自然疫源性疾病預防
要加強人間和畜間疫情監測，及時與畜牧獸醫部門互通信息，以便有效處置首發疫情，嚴防鼠疫、流行性出血熱、炭疽等疾病的發生或流行。（1）大力開展防鼠、滅鼠和殺蟲、滅蚊為主的環境整治活動，降低蚊、蟲、鼠等傳播媒介的密度；（2）要管好家禽家畜，豬、狗、雞應圈養，不讓其糞便污染環境及水源，豬、雞糞發酵後再施用，死禽死畜要消毒後深埋；（3）管好糞便廁所，禁止隨地大小便，病人的糞尿要經石灰或漂白粉消毒後集中處理；（4）臨時居所和救災帳篷要搭建在地勢較高、乾燥向陽的地帶，在周圍挖防鼠溝，要保持一定的坡度，以利於排水和保持地面乾燥。床鋪應距離地面2尺以上，不要睡地鋪，減少人與鼠、蚊等媒介的接觸機會；四是要做好鼠疫疫苗、出血熱疫苗和有關藥物的儲備，以便應急使用。
經接觸和土壤傳播的疾病預防
由於地震房屋倒塌，地面裂縫，山體坍塌，江河污染等原因，造成人員外傷，易引起破傷風、鉤端螺旋體病和經土壤傳播的疾病發生，對各種原因引起皮膚破損的人員必須及時注射破傷風抗毒素，對傷口進行清創縫合，給予有效的抗炎對症治療，嚴重的送醫院救治，教育廣大群眾破損的傷口不要與土壤直接接觸。
食源性疾病預防
災區不能吃的食品被水浸泡的食品，除了密封完好的罐頭類食品外都不能食用；已死亡的畜禽、水產品；壓在地下已腐爛的蔬菜、水果；來源不明的、無明確食品標誌的食品；嚴重發霉（發霉率在30%以上）的大米、小麥、玉米、花生等；不能辨認的蘑菇及其他霉變食品；加工後常溫下放置4h的熟食等。
要正確加工食品糧食和食品原料要在乾燥、通風處保存，避免受到蟲、鼠侵害和受潮發霉，必要時進行曬乾；霉變較輕（發霉率低於30%）的糧食的處理，可採用風扇吹、清水或泥漿水飄浮等方法去除霉粒，然後反覆用清水搓洗，或用5%石灰水浸泡霉變糧食24小時，使霉變率降到4%左右再食用。
搞好飲水安全工作選擇合格的水源並加以保護。首選井水，水井應修井臺、井欄、井蓋及井周圍30m內禁止設有廁所、豬圈以及其他可能污染地下水的設施，打水應備有專用的取水桶；其次選沒有污染的山泉、小溪和上游水，並劃定範圍，嚴禁在此區域內排放糞便、傾倒污水垃圾等；最後，可根據情況選接自來水供水管線、打手壓泵小口井等，集中式的飲用水水源取水點必須由專人管護。飲用水的處理與消毒：飲用水要經過澄清、過濾、消毒等處理後方可飲用。
