雖然我們想要除去有毒的細菌，如大腸桿菌與沙門氏菌等，但清水洗過只能把大部分有害的細菌洗掉而已，而一些特別毒的細菌，附著性特別強，用清水是不能輕易洗去的。
最近蕃茄感染事件，讓人不禁問這樣一個問題：蔬果用清水洗過後是否就更為安全了？
眾所周知，蔬果使用前洗一洗是很好的做法，但是否這樣一來就可避免細菌感染，不會重蹈之前蕃茄的感染事件嗎？
答案是否定的。根據專家說法，清水洗過只能把大部分有害的細菌洗掉而已，而一些特別毒的細菌，附著性特別強，用清水是不能輕易洗去的。所以，不論我們多麼努力的清洗，我們仍可能感染沙門氏菌與大腸桿菌等有毒細菌。
這次蕃茄感染爆發的主要是沙門氏菌Saintpaul血清型，一種能在人與動物腸道內存活的細菌，是十分少見的類型。美國食品及藥物管理局抽檢了383例自四月十日起蕃茄感染案件，以檢查感染來源。
位於美國賓夕法尼亞州美國農業部微生物食物安全部門的尼莫拉（Brendan Niemira）說道，截至目前為止，美國食品及藥物管理局仍不能說出出問題的蕃茄具體來自何方。一般來說，蕃茄的感染源可來自土壤、灌溉水、肥料、野生動物與農場工人身上，當然也可能是用戶本人，因為我們身上滿滿的都是細菌，其中也不乏致病病菌。
蔬果上的粗糙表面，常是病菌隱藏的溫床，即使如蕃茄如此平滑的表面，它表面仍是有小洞，可作為細菌的窩藏處。此外，細菌還有可能滲透到蔬菜表面組織之下。在2003年，美國新澤西州立Rutgers大學食品系一位教授曾發表論文，他通過一種透視顯微鏡觀察到，在用氯水清洗過的萵苣(Lettuce)葉子表層組織之下，仍隱藏著大腸桿菌（學名：Escherichia coli，簡寫為E. coli）。
尼莫拉提醒道，雖然我們對於粗糙表面的水果洗的時候要多加用心，但是如果過分用力清洗，仍可能傷及食物表面從而減少食物保存期限。食物表面傷到了，容易滋生腐敗細菌。雖然這些腐敗細菌較不具毒性，但卻可使食物更會窩藏其他有毒的致病菌，如沙門氏菌之類的。腐敗的細菌對人類傷害不大，但會侵襲食物，釋放出糖分還有其他營養物質，反而養活了有毒病菌。因此，食物即使輕微腐爛，仍會養虎為患地萌生一些有毒病菌。
美國食品及藥物管理局不建議清洗食物時使用清潔劑、肥皂、漂白水等。為了安全考量，應該考慮以下一些建議：
* 在處理蔬果時盡量不要傷及他們而產生瘀傷。
* 用冷水清洗蔬果
* 乾燥蔬果上多餘的水分
* 蔬果最好保存在冰箱內，溫度在華氏40度以下為好
* 看起來已經腐敗的蔬果就將之扔棄。
