有些自然療法專家認為健康的消化是治療所有疾病的關鍵，這也是為什麼像中醫這類自然療法都強調飲食改變、斷食等各種飲食調理方法在內的主要原因。
消化系統是人體最強的免疫系統，它透過化學作用打散食物，讓得以吸收、重建細胞，同時也負責消除食物裡的毒素。消化系統為了保護我們，不斷跟可能危害我們健康的外力抗戰。如果消化系統有差錯，我們的身體就會受到毒素侵害、或因為未完全消化的食物而營養不良，導致健康受損。所以，健康之道就在維持消化系統的良好運作。
要維持健康的消化系統，就必須控制心理、飲食及生理等三大因素：
心理還是維持健康消化系統的最重要因素，因為心理是身體各項反應的指揮中心。透過身心連結，我們所有動念都會改變體內神經系統、荷爾蒙平衡和化學作用，最後影響消化系統運作。飲食因素包括食物的選擇和進食的方法是否正確;而生理因素則包括咀嚼以及食物在腸道裡的移動。健康的消化必須三者兼顧。
生理因素：
專注咀嚼消化從咀嚼開始。食物分子愈小，就愈容易消化，養分也愈容易吸收;咀嚼的時間愈長，口腔所分泌的酵素和唾液就愈多，可減少胃部負擔。最後，咀嚼時間愈長，會讓我們愈有飽足感，因為它會激活腦部神經，讓人覺得吃飽了，因此嚼愈多體重就愈減愈多！
到底該咀嚼多少次?一般而言，食物咀嚼的次數愈多愈好，即使是喝水、果汁或湯，也務必咀嚼後再下肚。因為食物需要唾液幫助消化，而咀嚼則是製造唾液的唯一方法。
生理因素的另一個重要因子是纖維。飲食中纖維量若不足，食物就無法順利排出腸道，一旦停留過久會因細菌和酵母發酵導致便秘。如果你的纖維攝取量夠高，就會發現自己每餐飯後一定會排便，所以如果你一天只有一次，表示你飲食需要增加纖維量了！
如果一天排便不到一次，最好避免攝取含麩質的精緻澱粉類。基本上，所有用白麵粉作成的東西，包括麵包、餅乾、蛋糕和麵條等，都應避免食用，全麥麵包雖然還好，但便秘者最好完全避免食用小麥製品。
相對而言，腹瀉基本上並不是件壞事，它是身體迅速消除毒素的方法。如果你吃得很乾淨，卻常腹瀉，就可能食物過敏，根據研究，亞洲人的三大過敏原分別是牛奶和乳製品(約佔人口87%)、蛋(約81%)和小麥製品(約35%)。如果因過敏導致便秘，就不要再吃這些過敏食物，或者每個星期或每個月偶爾吃一次就好。連續幾天腹瀉，則表示體內這個清潔機制無法判別食物到底有沒有毒素，而一概予以排除。腹瀉時間過長會導致脫水，改變身體的電解質平衡，最後可能有緻命危險！
飲食因素：
食物下肚後就是胃的工作了。要有健康的胃，就必須明白它的運作原則，順勢而行。
許多人的胃酸不是太多、就是太少。最好的解決辦法就是改變飲食：早餐不吃甜食或純澱粉類，改吃蛋白質、蔬菜或水果，澱粉類則只吃粗穀類。這種吃法背後的道理很簡單：就是把蛋白質和澱粉類分開來，吃大魚大肉的話，澱粉類就少吃一點;吃麵條等澱粉類食物的話，就少吃蛋白質。建議你不僅早餐這樣吃，最好每一餐都這樣吃。
油脂非常難消化，不過卻是健康的必要元素，尤其是那些荷爾蒙有問題的人。最難消化的油是經過煎、炒、炸或烤等高溫處理的油。冷壓橄欖油、葡萄籽油和各種低溫處理的油，是最好消化的油，而且最好是生食。
你也可以創造自己的特製油，只要把醬油、紅辣椒、大蒜、洋蔥等東西和橄欖油或其它冷壓油混合放入攪拌機中，打碎後放入冰箱保存。之後你就可以把這個特製油加在食品上面，你會發現自己的消化不但變好了，皮膚有光澤，而且體重減輕了。
心理因素：
壓力對消化系統影響極大。壓力愈大，流到胃裡面的血液就愈少，使得消化遲緩，傷害胃壁細胞產生潰瘍和細菌感染，造成營養物質的缺乏，引發荷爾蒙失調、貧血、神經和肌肉緊張等問題，免疫系統因而變差，更容易罹患各種疾病。
壓力還會影響肝、膽囊、胰腺和腸道，造成消化不良、膽囊疼痛、血糖失衡、肝臟和各式各樣營養失調的問題。如果你想要改善消化系統、保持健康，最重要的就是要控制壓力。
想對抗壓力，需要足夠的休息和娛樂的時間，過自己想過的生活、實現夢想，讓生活保持均衡，並設法找出壓力的來源。例如：讓用餐時間變成放鬆時間，不要看報紙、也不要看新聞報導，放一點輕鬆的音樂，點幾根蠟燭，然後慢慢的吃。談或想浪漫、好玩或有趣的事情。不要批評、吵架、討論令人不快的話題。不論面臨的壓力有多大，讓你的三餐變成放鬆、享受的時刻！
提高消化效能的建議：
1、飯後慢慢散個步，不但可幫助食物的消化，而且可以讓你整個人放輕鬆。
2、每口肉都配一小條薑絲，因為姜能刺激消化，同時也可多喝熱薑茶。
3、多吃生木瓜或菠蘿（兩者都含有消化酵素）。
4、每天早上空腹和上床前喝一杯高麗菜汁或蘆薈汁，可幫助修復消化道內緣。
5、定期食用優格或泡菜類天然發酵的食品。其中含有的嗜酸桿菌，對腸道健康非很有利。
