朝鮮戰爭自1950年6月25日持續到1953年7月27日（以南北朝鮮簽署《關於朝鮮軍事停戰的協定》為標誌），在此期間，當時的朝鮮最高領導人金日成開始對身邊的元老級人物進行打擊；到了1956年，金日成正式對黨內「親中派」（又稱延安派）和「親蘇派」實施「大清洗」，直到1958年才宣告「勝利」。
清除「樸憲永集團」
樸憲永（1900年——1955年）是威望很高的政治家，他在十九歲時便參加了朝鮮「三一運動」，後因日本警察的追捕而流亡中國上海。1945年，朝鮮取得獨立後，以樸憲永為領導的朝鮮共產黨中央領導全朝鮮共產黨的活動。同年，金日成從中國回到朝鮮後，一方面表示接受在漢城的樸憲永中央的領導，另一方面建立了朝鮮共產黨北方局，但這在初期遭到漢城中央的批評，北方咸鏡道黨組織甚至一度表示不接受北方局的領導。
1947年，由於南朝鮮當局和美國的鎮壓，朝鮮共產黨中央無法在漢城立足，領導人物紛紛被迫撤退到北方，於是在蘇聯的撮合下，南北雙方達成了聯合協議，正式成立了朝鮮勞動黨，以金日成為委員長，樸憲永為副委員長。
朝鮮戰爭爆發後，樸憲永負責策動南方黨組織和民眾起義，由於戰爭失利，南方黨實力大減。朝鮮勞動黨內即指責南方的勞動黨在解放戰爭中沒有做到發動人民起義配合人民軍進軍的計畫，從而把戰爭失利的責任推到南方勞動黨領導身上。
1953年3月，司法部長李承燁、駐中國大使全五稷、第一屆最高人民議會議員金午星、南朝鮮解放游擊第十支隊長孟種鎬、勞動黨聯絡部長樸勝源、勞動黨聯絡部長裴哲、勞動黨社會部長姜文錫、內務省幹部白亨福等十人被判處死刑，另有兩人分別被判處十五年和十二年有期徒刑。
當時，作為勞動黨第二把手的樸憲永也不能倖免於難，他於1955年12月15日被判處死刑。上述等人都是以「美帝國主義雇佣間諜」的名義起訴的。
老帥功高動不得
朝鮮戰爭爆發後，金日成的朝鮮人民軍突破三八線一路南下，人民軍的主力是從中國歸國的中國人民解放軍第四野戰軍的兩個朝鮮族師和在中國人民解放軍各野戰軍服役的朝鮮族官兵以及從蘇聯歸國的旅蘇朝鮮僑民。
旅蘇朝僑大都是坦克兵。所以金日成的陸軍主力和裝甲部隊都極為強悍。他自己的那些游擊隊卻不值一提。由於金日成給蘇聯的報告是美國不會出兵干預，所以斯大林默許了金日成的軍事行動。結果由於金日成笨拙的指揮，導致在釜山前線的人民軍主力被麥克阿瑟從仁川登陸的美軍截斷後路，基本被殲滅。大約11萬朝鮮人民軍成建制被俘虜。要不是朝鮮副帥崔庸健帶領少數部隊拚死扭住美軍使之不能迅速北上形成合圍，金日成早就成了美軍的俘虜，到美軍戰俘營去啃窩窩頭了。
崔庸健是一位忠厚的將領，他在抗日戰爭時期就已經是戰功卓著，當金日成隨著蘇軍回國時，崔庸健正在中國東北匯報工作。因為按照共產國際的決定，解散朝鮮共產黨，朝鮮黨員並入中國共產黨，崔庸健嚴格遵守既定的組織程序，所以被金日成鑽了空子。但是，即使崔庸健先於金日成回國，這位親華的朝鮮領袖也不能被蘇軍接受。
崔庸健本人沒有政治野心，他一心擁戴金日成為領袖，在美軍仁川登陸後又死戰不撤，給金日成率殘部退入北朝鮮爭取到了黃金般的寶貴時間。其實只要崔庸健稍一退讓，金日成必敗無疑，而此時的朝鮮領袖必將是他這位次帥。由於崔庸健的崇高威望，金日成後來的清洗始終不敢動這位老帥，1970年上趕著要跟中國友好，還得派這位老帥訪華。
大規模清洗延安派和親蘇派
朝鮮戰爭結束後，中國軍隊沒有立即撤兵。當時朝鮮軍隊分為兩派，一是親蘇派，一是親中派——即中共在延安培訓的幹部。由於得不到中國軍隊的支持，延安派自然也未能倖免於難。金日成在1951年以「平壤失守」和「作戰不力」為由解除了延安派勢力最大的人物、民族保衛省副相兼人民軍炮兵司令——武亭手中的權力，武亭被彭德懷接往中國。被認為是毛澤東個人代表的朝鮮內務相樸一禹也被解除職務。
1956年2月，蘇聯領導人赫魯曉夫蘇聯共產黨二十大會議上猛烈在批判斯大林，並藉機指責金日成在朝鮮大搞個人崇拜。四個月後，金日成訪問蘇聯，赫魯曉夫曾要求金日成放棄個人崇拜。根據記錄了當時朝蘇兩黨會談的蘇共內部文件記載：蘇共向朝鮮同志提出忠告，朝鮮勞動黨存在嚴重錯誤，對金日成進行個人崇拜。金日成接受了蘇共的提議，同意採取措施改正缺點。
蘇聯的動向使得朝鮮國內的延安派受到鼓勵。延安派暗中策劃對金日成的批判。實際上，從哪一方面看，金日成也不配擔任朝鮮的最高領袖。1956年8月29日，朝鮮勞動黨舉行蘇聯、東歐歸國報告會，親蘇派的樸昌玉和延安派的崔昌益等人公開向金日成挑戰。
1960年代初期亡命韓國的前朝鮮副總理助理吳基完見證了延安派發難及失敗的全過程：延安派的一位成員在朝鮮中央會議上剛一發言，立刻遭到金日成游擊隊派一哄而上的高聲謾罵以至於無法繼續發言，會場亂作一團。其他延安派連發言的機會都沒有，實際上金日成的臥底已經洞悉了延安派的意圖，因此金日成迅即反撲，把涉及的延安派成員全部開除出黨。當天延安派的商業部長尹金欽、職業總同盟委員會委員長戌輝即逃亡中國，而崔昌益和樸昌玉被逮捕，後來在8月的中央全會上被除名。
不久後，蘇聯第一副總理米高揚、中國國防部長彭德懷先後訪問朝鮮，兩人都要求撤回對親蘇派和延安派的除名處分，因而在9月的中央全會上，崔昌益和樸昌玉又被恢復了中央委員身份。
但金日成的清洗運動遠沒有完。1956年9月，朝鮮勞動黨內僅存的一小部分未被清洗蘇聯派和延安派分子聯合要求金日成停止對他們的迫害，但這一抗議毫無效果。延安派於1958年被清洗完畢，蘇聯派於1961年被清洗完畢，這兩派的倖存成員大多數選擇了中國或蘇聯。更可惡的是，金日成追殺到中國來，管中國要人，因為當時駐蘇大使也叛逃了，也是反金日成的。這樣中蘇就商量怎麼辦，後來就找金日成談，讓他算了。金日成提出的條件是中國把志願軍撤了，你不要幾十萬軍隊老在我這，實際上他對這個是很恐懼的。這樣達成一個協議，中國到58年以前把部隊都撤走，你們這幾位也算高級領導幹部也不要再追殺了。這也是抗美援朝中最大的敗筆！中國死了那麼多優秀士兵，到後來也沒有培養一個親中國的政府，匆匆撤軍。到了1956年底，朝鮮勞動黨開始換發黨證（實際就是進行清黨運動）。1957年，金日成借這一運動將黨內的延安派、親蘇派以及南朝鮮勞動黨派系的殘餘一網打盡，親蘇派中仍保留蘇聯國籍者在此期間全部返回蘇聯。
經過一場轟轟烈烈的清洗運動後，到了1958年3月，朝鮮勞動黨第一次代表大會上，金日成將這一連串事件形容為一大勝利，從此，以其為主體的游擊隊派獨佔了朝鮮的領導地位。據統計，到1961年9月，四次代表大會選舉出的85名中央委員中，原來三次代表大會選舉出的71名中央委員連任者只有28人，而其餘 43人中大部分是遭清洗的延安派和親蘇派。
金日成還在朝鮮全境開展思想整肅，後來解密的蘇聯內部文件記錄了金日成的清洗過程：在一個月內，有兩千多人遭到整肅，其中四百多人以反對朝鮮政治體制的名義被公開槍殺。
附：北朝鮮革命元老的結局
金日成(自然死)
崔庸健(自然死)
洪命熹(自然死)
白南雲(自然死)
樸憲永(死刑)
李承燁(死刑)
張時雨(死刑)
朱寧河(死刑)
許成澤(死刑)
李炳南(死刑)
李 鏞(死刑)
樸文圭(不詳)
金 策(疑問死)
許 憲(事故死)
金元鳳(臨政系，死刑)
樸一禹(延安派，死刑)
金武亭(延安派，死刑)
金枓奉(延安派，死刑)
金 雄(延安派，死刑)
崔昌益(延安派，死刑)
樸勛一(延安派，死刑)
方虎山(延安派，死刑)
張平山(延安派，死刑)
樸孝三(延安派，死刑)
金漢中(延安派，死刑)
李益成(延安派，死刑)
李芳南(延安派，不詳)
許貞淑(延安派，自然死)
