從1988年開始投入氣功研究
李嗣涔和氣功的第一次接觸必須回溯到1988的十四年前，當時國科會主任委員陳履安潛心向佛，召集了十幾所大學的學者專家組成氣功研究團隊，團隊成員有醫生、物理學家、醫學工程專家、電機專家及生命科學專家等，目的是想透過科學實證的方法瞭解氣功是真的嗎？煉氣功的時候，身體產生何種變化？對身體有什麼幫助？
為了要探討氣功的真實性，李教授發揮了「親身實證」的精神，自己親身煉氣功，才煉到第三次就發生氣集丹田、氣走任脈的現象，當時他對人體的奇經八脈一竅不通，只好看大量的相關書籍，從此一頭栽進了這個以往被視為「迷信」，甚至是「怪力亂神」的神秘領域，而且樂此不疲，其研究成果已獨步全球。
從氣功到特異功能的研究
研究氣功五年後(1993年)，李嗣涔注意到當時中國大陸的氣功熱，當時有些氣功有非常驚人的祛病效果，而且傳出一些特異功能者具備手指、耳朵識字的能力。而傳統科學根本無法解釋這些現象，李嗣涔因而從研究氣功跨入特異功能的研究。
李嗣涔除了對已有特異功能者進行實驗外，也開始自行訓練七至十四歲的小孩。這些自願接受的青少年中，大約有10%到40%可以成功的開發出手指識字的功能。因此，李嗣涔有了穩定的實驗對象來源。經過上千次以上的實驗後，證實手指識字以及辯識顏色絕非幻覺，也深入的分析功能人的神經脈衝等身體變化。
手指識字與第三隻眼
李教授指出，手指識字其實並不是因為手指「觸摸」到了字，因為，將寫上字的色紙，放入小盒子後再放進大盒子，具有特異功能的人還是可以精確辨識出顏色。
另外，即使被測試者在15公尺以外進行實驗，仍然可以認字和辨識顏色，所以完全和觸覺無關，根本不能用現有的生理學、心理學和物理學的認識解釋這個現象。
那根本不是手指識字，李教授指出，這是大腦在某種狀態下，可以不通過視神經、觸覺神經直接和外面物質產生交互作用，據功能人陳述，大腦中會出現一個發亮的屏幕，字條上的字辭圖像就會在這個屏幕中「跳」出來，這似乎就是傳統修煉界中講的「第三隻眼」。
※(實驗記錄)當以手指辨識寫有「藥師佛」紙條時，陳小弟弟看到（並畫下如上圖）有人拿一個碗，周圍亮光（黃、閃），碗有味道，然後出現字「藥師佛」。
看不到「佛」字，只見到強光
1998年8月26日那天的實驗中，實驗小組成員，現任行政院同步輻射中心主任，享譽國際的實驗物理學家中研院院士陳建德教授，由於篤信佛教，就寫了一個「佛」字來測試。沒想到功能人竟然只能看到強光，無法認出佛字。有時甚至還出現亮人的影像，而且還會跟被測試者同時出現在屏幕之中！這個驚人的發現，讓研究人員開始進入了「身心靈」的「神靈」的研究。
手指識字實驗中，為驗證「佛」字的特殊性，把佛字相近的字如「佛」「拂」等拿來試驗，結果只看到這些正常的字，並無特殊現象。但是給「比佛利山」，結果看到「比」「利」「山」三個字，中間「佛」字的地方，還是看到一團光。用「佛」字的注音符號，也看到一閃的亮光。給手指識字者看「耶穌」，看到的是發光的外國人。當然不同的特異功能者，由於層次不同，看到的也不一樣。
神靈的世界顯然是一個善良純正的世界，與訊息場的溝通，也必須是正心誠意的正念。而李教授的實驗首度以「科學」的方式，觀察證實了我們的世界除了知道的宇宙時空之外，還有一個高層空間的信息場存在。
至今已累積了上千次以上的實驗結果，李教授發現功能人對「神佛」的名字都能看到異象，李教授將這些神聖名字比喻為網站的名字，它們可以聯通高層生命的信息場（網站），而功能人的能力強弱，就像是瀏覽器的功能強弱，所聯通的訊息也有強弱之別。而透過紙條上寫上問題，功能人的屏幕則可以接收高層信息場的回應訊息。
與神靈的溝通
透過手指識字者，實驗研究人員請教神靈，不同宗教所講的最高層次世界，是一樣的嗎？得到的回答是英文：「I don't like to compare」（我不想比較）。李教授推斷神靈不肯告訴人類天界的關係，可能是擔心對人類造成不良影響，甚至是不同宗教間無謂的紛爭。事實上，當實驗者問到類似神靈世界的「人事或階層」有關的問題，都得到不願回答的結果。
當問到地球人類何時可以和外星文明接觸時，回答是：「不是已經有了？」再問：「現在的外星文明中距地球最近的是在哪一星座？哪個星星的行星？」答案是英文「anywhere」（任何地方），什麼意思呢？可能就在你我周圍，只是人類無法感知而已啊！
舉頭三尺有神明
李教授長期研究氣功、人體特異功能、和神靈世界，語重心長的指出，從功能人傳回的神靈訊息來看，神靈就在實驗室中看著他們做研究，神靈也有可能介入干擾，所以神靈是無所不在的，老祖宗說「舉頭三尺有神明」，其實「三尺」以內也隨處都在。因此，人要心存善念，言語說話都應誠敬。
他表示，投入氣功和特異功能研究後，對科學和宗教的本質已有嶄新的認識，事實上，科學與宗教都是探討生命起源和世界結構的方法，科學研究的是我們這個世界的結構，宗教則觸及另一個世界的結構；在宗教中修煉是認識和進入神佛世界的方法，而運用科學的方法也有機會和神佛世界溝通，但是，科學家的目的必須是研究真理，而不能想要求名求利，甚至想猜一猜樂透中獎的號碼。
從「踢館」到「大開眼界」
李嗣涔等人的研究成果，引起了傳統科學界的質疑，向實驗小組表示要組隊參加手指識字實驗，並且在物理學會網路上公布訊息，公開邀請大家來見證。他們要求自行準備實驗樣本，並要求李嗣涔等人不得經手樣本參與實驗。李教授說，說白了，這就是來「踢館」的。
實驗小組欣然同意這項挑戰。1999年8月26日，由中華民國物理學會、台大物理系、清華物理系、台大心理系和中研院的十多位教授，組成了小組，各種道具事先準備齊全。結果，放在盒子中的紙，只要不用鉛包住，其中功能最強的小孩，都能準確的說出或描畫出紙的顏色和紙上的字或各種奇怪的圖形。實驗進行沒有多久，這些物理學、化學、心理學教授們大開眼界，直呼不可思議。最後，連中研院院長李遠哲都肯定李嗣涔的研究成果。李教授很欣慰的表示：從此以後，幾乎就不再聽到公開批評他的聲音了。
美國的「另類醫療」研究 即將起飛
李嗣涔教授在第五屆「身、心、靈科學」學術研討會開幕致辭時指出，美國國家衛生院(NIH)今年已撥款一億美金，投入「另類醫療」的研究，研究各種靈療和民俗療法，開始探索「身、心、靈」的現象。
美國各大醫學院已有三分之二以上，將「另類醫療」列為選修課程，有的大學醫學院甚至將其列為必修課程。這個領域顯然已吸引了許多科學家投入研究。這類的研究，美國現在大約落後中國十年，不過一旦他們大量投入研究，可能很快會迎頭趕上，創新格局。
李嗣涔表示，臺灣大型醫院或醫學院已著手或考慮進行這個研究方向。「靈」或「另類存在」的研究已經是二十一世紀最具挑戰性的學問。
李嗣涔小檔案
李嗣涔教授，1952年次，台大電機系畢業，美國史丹福大學電機工程博士，專長為半導體光電元件。李嗣涔教授為國立臺灣大學電機系、光電所、電子所奈米電子組、生醫電資所教授。曾任台大電機工程系系主任、現任台大教務長，2005年就任臺灣大學校長，於2013年任期屆滿後卸任。
李教授專業研究傑出，五度獲得國科會傑出研究獎，並先後榮獲中山學術著作獎(1987)、中國工程師學會優秀工程師獎(1987)、亞太材料科學院院士(1997)、國際電機電子學會千禧年獎章(2000)等。
1988年在信佛的國科會主委陳履安的鼓勵支持下，參與氣功科學研究，從此改變他對傳統文化與生命的看法，轉而追求身心靈的圓融。1992年研究興趣轉向人體特異功能。
李教授除了多篇學術論文，並與夫人鄭美玲女士共同出版《難以置信－科學家探尋神秘信息場》一書，記錄大量各種特異功能現象和研究結果。
