康生和他的第二任妻子曹軼歐。（圖片來源：維基百科）
從1937年起，康生還先後在中共陝甘寧邊區炮製了幾起著名的「特務」案件，進一步強化了人們關於「敵情」嚴重性的觀念。
「你長那麼漂亮，不當特務，誰當特務！」
最著名就是是錢維人案。錢維人原是邊區公路局長，國共合作開始時，他曾負責與國民黨方面聯繫建築公路之事。康生多次說他是「內奸」，後下令將其逮捕。二是王遵及案。王遵及是大漢奸王克敏的侄女，她因不滿漢奸家庭，要求抗日，來到延安。康生懷疑她是「日本特務和國民黨特務」，下令將其關押起來，進行逼供，曾三天三夜不讓其睡覺，要她承認是國民黨特務組織復興社的成員。1939年，康生親自寫信，要求嚴訊王遵及，使其承認是復興社特務。三是李凝案。李凝原是東北地下黨員，曾被日本人逮捕，後經家人保釋出獄。她於1938年到延安，1939年7月突然被邊區保安部門逮捕。康生逼其承認「叛變投敵為特務，打入黨內充當漢奸」。在一次審判會上，康生蠻橫地說道：你長那麼漂亮，不當特務，誰當特務！最後在定罪結論上寫道：走路像日本女人；有日式女內衫；刺探軍事秘密等。這些案件雖然後來都被證明是莫須有的，但當時在延安卻引起了很大的轟動。
由於有了這些事實做根據，1943年3月16日，毛澤東在中央政治局會議上指出：整風既要整小資產階級思想，同時也要整反革命。過去我們招軍、招生、招黨，招了很多人，難於識別。抗戰以來，國民黨對我們實行特務政策，在社會部和中央黨校都發現了許多特務。現在我們要學會識別特務和賢才。在延安，年內要完成審查幹部、清洗壞人的工作。此後整風運動進入了審查幹部階段。
延安整風的目標就是發現內奸與肅清內奸
1943年3月20日，康生在中央政治局會議上匯報說：抗戰以來，國民黨普遍實行姦細政策，最近從審查幹部中才發現這一政策的陰謀。根據康生的匯報，劉少奇當天就向華中局發出《關於警惕國民黨特務政策》的電報，指出：最近延安在整風及全面清查幹部思想歷史的過程中，發現大批國民黨特務與日本特務，今天我們向國民黨鬥爭的主要方式是特務鬥爭。我們要把反特務鬥爭看成和軍事、政治、經濟鬥爭一樣的重要。
4月3日，中共中央發布《關於繼續開展整風運動的決定》，指出從1943年4月3日到1944年4月3日，「整風的主要鬥爭目標，是糾正幹部中的非無產階級思想（封建階級思想、資產階級思想、小資產階級思想）與肅清黨內暗藏的反革命分子」。前一種是無產階級思想與非無產階級思想的鬥爭，後一種是革命與反革命的鬥爭；整風運動既是糾正幹部錯誤思想的最好方法，也是發現內奸與肅清內奸的最好方法。
4月24日，中央書記處決定，高中級幹部教育計畫暫緩三個月發布，在5、6、7三個月內，專門進行防姦教育。總學委負責這一工作，總學委副主任康生負責日常事務。在審幹階段，儘管毛澤東在開始的時候，由於受康生的影響，對形勢的估計也過於嚴重，但他還是一再要求，各級幹部既要提高革命警惕性，對壞人堅決鬥爭，又要掌握政策，重在教育，要嚴禁逼供信。但康生為了擴大戰果以邀功請賞，對此卻充耳不聞。
康生為擴大戰果製造冤假錯案
不久，康生就搞出了一個張克勤「敵特」案，並以此為突破口，在全邊區範圍內大肆反奸捉特，一時間特務如麻，搞得人人自危，人心惶惶。
張克勤原名樊大畏，時在社會部所屬的西北公學學習。因其父在蘭州被敵人逮捕自首，本人對領導提意見偏激，加上一名與他同來延安的在魯藝學習的人檢舉他是特務，所以被康生下令看管起來。在關押過程中，年僅19歲的張克勤受到逼供，在經過六天六夜的「車輪戰」的肉體折磨和「假槍斃」的威脅以及「坦白了可以保留黨籍」的誘逼後，他「招出」了甘肅地下黨是打著紅旗反紅旗的「紅旗黨」，是國民黨「紅旗政策」的產物之類的虛假口供。
對於這樣一個完全靠逼供產生的假案、錯案，康生卻如獲至寶，他讓張克勤騎著高頭大馬，佩上紅花，到各機關學校作講演，介紹他的「特務」經歷和反悔過程。康生到處宣揚「紅旗政策」是國民黨對共產黨內奸政策的新策略，從而得出在國民黨統治區的黨組織不可靠、必須重新估計的錯誤結論。並隨即開展了大規模的追查，把來自甘肅、河南、湖北等地的地下黨員和進步青年中他認為可疑的人，捕押起來，審問逼供。據師哲回憶，1943年4月1日晚上，康生召集邊區保安機關的負責人開會佈置工作，提出要抓捕的名單。當時擔任邊區保安處一局局長的師哲問康生：要抓的人有沒有材料，沒有確切材料，怎麼審問？康生卻答到：有材料還要你們審問幹什麼？結果這一夜就抓了260多人。
