对于如何处理因抗SARS不力而下台的前卫生部长张文康，目前中国大陆有好几种不同看法，有的人认为张文康之罪足以移送法办，按刑法处死都不为过；有的人则指出张文康被黜只是中国官场弃车马保将帅的一贯手法，张文康是依照惯例或上意处理SARS的消息发布，他不可能瞒报疫情；还有人则表示，当初中国科学院及卫生部的一部分专家，经研究发现衣原体是SARS病原，张文康信任他们的说法是很自然的，本来SARS就是一个新的病种，认识它总要有一个过程。
在各种看法纷陈的情况下，有两个现象可能反映中共在总结SARS事件责任归属时的方向。一个是五月三十日，卫生部常务副部长高强在记者会上公开表示，他不认同张文康是因为瞒报疫情而被免职，高强还透露，他最近才和张文康见过面，讨论了关于防疫工作的一些问题。第二个则是稍早的五月二十七日，两岸防治SARS视讯会议上，当初力主SARS病原为衣原体之说的洪涛出席会议，而依据中共一向的作风，这代表洪涛并未受责。
这样，情况就很明显了，中共对SARS风暴责任归属问题的立场是：张文康是因为对SARS的严重性估计不足而被免职，但是他之所以会产生这种错误估计，则是由于有部分病毒学家提出衣原体之说所致。既然张文康没有瞒报疫情的问题，当然也就不会法办，案情将止于此，不会向上发展。
然而，衣原体之说究竟有何份量，能保护张文康或甚至成为中共政权脱逃抗SARS责任的护身符？这是因为衣原体是一种已经能被药物克制的微生物，冠状病毒则否。如果判断SARS由衣原体而引发，则SARS不是什么可怕的疾病就是很自然的推论，接下来各种防护缺失也就是可以解释的。
回溯今年二月十八日新华社的报导，即可明白其中的微妙。报导说，中国疾病预防控制中心和广东省疾病预防控制中心基本确定，引起广东省非典型肺炎的病原是衣原体。衣原体是一种在真核细胞内寄生的原核微生物，所引起的肺炎采用针对性强的抗生素治疗非常有效，该病也是完全可以预防的。直到四月初，中国疾控中心病毒预防控制所首席专家、中国工程院院士洪涛，还支持这项主要是根据他的研究主导的看法。四月四日，中国疾控中心主任李立明也公开表示，衣原体可能是SARS的病原。
不过在此之前，香港中文大学医学院院长钟尚志已于三月十八日深夜公布，SARS的元凶是一种副黏液病毒科的病毒；三月二十七日，香港大学医学院院长林兆鑫则证实，SARS是由冠状病毒引起。世界卫生组织更在四月十六日正式确认冠状病毒的一个变种，是引起SARS的病原体。
然而，当衣原体之说在失去医学地位的同时，其政治效用却又暗中升起，成为SARS风暴中最吊诡的现象。如果说，北京当局是因为被衣原体之论而误导，之后的惨重伤亡就是非战之罪。那么所幸的是，在二月份京派专家提出衣原体之说后，广东方面的专家立刻就提出了质疑。当时广东省绝大多数专家对衣原体说持保留意见，认为SARS是病毒性肺炎的可能性极大，因为衣原体肺炎一般呈散发性，但广东的肺炎是局部性流行，同时衣原体肺炎死亡率不高，发病也不凶险，但SARS不同。有鉴于此，广东的专家说，不能按照衣原体的结论来制定治疗方案，否则可能造成可怕后果，他们表示，广东将会按照既定预防治疗方案行事。这样问题就进一步明晰了，中共当局不论是卫生部或更高层的负责人，在SARS狂飙般袭来的时候，不是误不误信衣原体之说的问题，而是在衣原体和病毒说之间误不误判的问题，也就是有没有足够的智慧做出正确判断的问题。如果仅仅二月份广东就至少有八百人患病，如果仅仅一个月内广东中山大学附属二院有近百名医护人员被感染，如果广州军区的医院同样被大面积传染，而中共高层还不能看清事实真相，还要等到北京疫情紧张，国务院副总理吴仪在网球场上由友人亲口反映才体认事态严重的话，那么中共的官僚体系真的是病入膏肓。至于靠衣原体卸责，那就更罪无可恕了。
