日本正式提出抗议
11月12日，日本认定10日潜入其领海的核潜舰隶属中国海军，并召见中国驻日公使程永华(音译)，正式提出抗议并要求解释。程表示，中国当局正在调查此事，他将向北京转达日本的抗议，但他无法立即表示道歉。
日本官方11月10日证实，当天清晨5时左右，在琉球宫古列岛的多良间岛附近，发现“国藉不明”的核动力潜舰潜航侵入日本领海。按照国际海洋法，潜水舰进入或经过别国领海，必须打出国旗升上水面。日本防卫厅紧急发布“海上警备行动命令”，提高战备等级，同时派遣2艘护卫舰与直升机前往现场追踪。该潜舰潜航3小时后离开日本领海，日本媒体报导说，这艘潜艇后来向中国沿海方向驶去。
首相小泉纯一郎12日晚上对事件表示极为遗憾，但强调要以中日友好大局为重。不过，日本媒体对此事的反应强烈。《读卖新闻》发表社论说：“日本完全有权要求北京就侵犯日本主权道歉，并要求北京今后不再发生类似事件”。
中国低调回应
针对东京当局要求中国政府为其核潜舰道歉一事，中国外交部13日重申：它正就日本的指控与其他国家政府协商。中国外交部发言人章启月说：“至于这艘潜艇是不是中国潜艇，我不知道，也无法提供这方面的资讯。”中国所有官方媒体只字不提日本就中国核潜艇侵入日本领海提出抗议一事。
11月13日，中国驻日本大使王毅敦促日本在解决双边龃龉时保持冷静。他在和歌山县举行的执政自民党研修会上发表演说时表示，“中国和日本之间不时发生风波，但理应相互尊重，冷静谋求解决方案。”据报导，王毅未直接提及潜舰入侵事件，但藉由发表演说再度抨击日本首相小泉纯一郎赴靖国神社参拜一事。
中日关系处于敏感时期
中日关系最近非常脆弱。上个月，双方就东海石油天然气开发权的谈判破裂。 最近由于日本首相小泉纯一郎朝拜靖国神社，中国暂停了原定中日双方间的高峰会谈。而此次核潜艇发生在本月下旬智利举行的APEC亚太经济合作首脑会议前夕，中国和日本官员原本希望安排小泉首相和中国国家主席胡锦涛会晤。
日本媒体日前报导了一份防卫厅的内部档，提出3个中国可能攻击日本的假设状况，引起中方不悦。这3种假想分别为：中国与台湾爆发战争时袭击日本以阻止驻日美军援台；中日领土纷争导致武力夺取钓鱼岛；中国为确保东海资源利益对日作战。
日本参议院10日有关日圆借款的会议上，国会议员多数主张把中国从借款名单上除名。不少日本人认为，中国经济发展已到相当水平，也有人担心中国把日本援助的款项部分挪用发展军事。
分析人士认为，自日本首相小泉纯一郎9月27日完成内阁改组，任命町村信孝出任外务大臣后，日本对中国的外交出现了“反守为攻”的趋势。虽然日相小泉多次重申中国并非威胁，但“中国威胁论”不断被提及，中日关系要改善将会更加困难。
大纪元
