自枢机团于一九七八年选出若望保禄二世继任教宗以来，刺探这项机密的手法已大幅精进，不可同日而语。但对已有数百年历史的教宗秘密选举作业是否安全，梵蒂冈似乎胸有成竹。匿名官员表示：“我们又不是第一次召开枢机秘密会议。”
梵蒂冈安全当局不愿说明将采取哪些反入侵措施，但曾在罗马警局服务的私家侦探玛祖洛指出，除编制内的保全专家外，教廷还将结合意大利警方和私人保全公司之力，共同维护秘密会议的安全。
罗马警局向与教廷密切合作，玛祖洛表示，秘密会议的保全工作将是滴水不漏。对意图窃密者而言，“就算还有机会，也是微乎其微。”
一百一十五位枢机主教将在18日集会，届时势将成为数千名媒体记者的目光所在，骇客和政府情报人员也将严密监控这场会议。在新教宗顺利产生前，会议地点西斯汀教堂全面封闭，除枢机团必须宣誓保密外，任何直接或间接与教宗选举有关者亦须保密。
教宗选举将可能出现激烈竞争，尤其是在壁垒分明的改革派与保守派之间。此外，推举首位非欧洲籍枢机主教出任教宗的声浪也颇为强劲。
对教廷来说，选举过程曝光将是极为难堪的场面。例如，教宗候选人对与伊斯兰教穆斯林、犹太教徒的关系持何种立场？是否与台湾断交，转而与中国建交？以及对避孕的观点是否受到政府和媒体欢迎等。
波兰共党统治期间特务横行，若望保禄二世成长于斯，因而对外来干预极为敏感。他在一九九六年下令修改教宗选举办法，为枢机团创造一个足以行使独立判断的空间。行动电话、个人数位助理（ＰＤＡ )、无线电收音机、报纸、电视和录音机都禁止携带入内。
安全专家指出，禁止携带行动电话和ＰＤＡ有其道理，因为这些通讯装置很容易被动手脚，足以使讯息外泄。
此外，高敏感度窃听器材也是梵蒂冈的一大隐忧，尤其是先进的雷射麦克风：透过记录玻璃窗或其他硬质表面的震动频率，连四百公尺外的对话都可以收得一清二楚。雷射麦克风的破解之道，在于装设厚重的窗帘，并以干扰杂讯掩盖对话内容。
只有铜板大小的发话器或录音机则更难防范。反窃听人员必须在敏感的会议区装设先进的反窃听装置，彻底检查地毯、椅垫、暖气送风管、电线、灯泡和水管等处。
若望保禄二世对教宗选举会议的安全问题极为重视，曾下令若有枢机主教违背誓约泄密，将遭到被逐出教廷的严惩。由于本次教宗选举会议将首次开放枢机团在梵蒂冈自由活动，枢机团9日作出史无前例的决定：暂停接受媒体访问，显示教廷对维护选举会议的隐密性不敢掉以轻心。
