“国家民主基金会”提供的资助大多用于推动中国民主、人权、新闻自由和劳工权利，这些经费大多是通过流亡在美国的异议组织来落实的，基金会每年组织“专家们”对这些项目的执行情况进行考评，效果好的予以保留或增加资助，执行效果差的被淘汰。“国家民主基金会”促进中国乡村选举的资助是通过“共和国际研究所”来实现的，用于推动香港政治改革和政党建设的资助主要是通过“国际事务国家民主研究所”来执行，后者在香港设有办事处。
最新的年度报告透露，“国家民主基金会”在2004年资助香港“平民交流”组织12.5万美元（约97万港元）、“香港人权监察”17万 3,280美元（约135万港元）；为“国际事务国家民主研究所”的两个项目提供24万美元（约187万港元），用于香港政党磋商和培训，开展和出版多党民意调查，为2004年9月的立法会选举提供选民指南方面的帮助，帮助香港民间组织的民主化和提高管理水平，支持香港的合作伙伴对特区政府的执政情况进行评估以及立法会选举后的评估。
成立于1983年的“国家民主基金会”为美国针对中国的“国际劳工团结中心”的四个项目提供了46万美元的经费，为“中国私有化企业中心”的五个项目提供 39.5万美元（约307万港元）的资助，为推动中国乡村选举的“共和国际研究所”提供35万美元。同时接受资助的流亡美国的异议组织有“司法权利教育”、“当代中国中心”、“中国信息中心”、“中国21世纪基金会”、“中国人权”、吴宏达的“劳改研究基金会”、《北京之春》、《民主中国》、“中国独立作家中心”和《新闻自由导报》等。
该基金会去年资助“国际援助西藏运动”等7个流亡海外的藏独组织23万美元（约179万港元），这个数目与前几年差别不大。但值得注意的是，“国家民主基金会”去年为鼓吹先自治后独立的“美国维吾尔协会”提供7.5万美元（约58万港元）的资助，据说是为了引起国际社会对新疆维吾尔自治区人权被侵犯的注意力。该协会得到美国的资助后，在白宫附近租了一套办公室，在美国进行游说并开展耸人听闻的反宣传。
