为贯彻陈水扁的指示，行政院将由海巡署从台湾本岛调派二十艘巡防舰、巡防艇与胶筏，于十九日晚紧急集结前往金马地区执行任务，针对离岛当地的安检、巡防、登检，皆将施以强势作为，规模亦历来罕见，务必让金马民众与对岸了解台湾政府的决心。
高层会议决定，为提早因应秋冬季节来临前的疫病高峰，政府应在会议结束后就立即行动，自今日起实施金马澎联合大扫荡，对台湾前线海域执行净空计画，同时台湾本岛的各巡防区也将同步进行联合作业；为确保任务的成果与震撼性，这项机密内容总统府并未对新闻界公布，而由主管单位连夜部署中。
据了解，“晴空”专案虽由海巡署主司其职，但十九日与会的国防部长李杰将配合这项任务，调派海军在远距离予以监看，以便在万一发生特殊情况时能立即从旁协助，也具恫吓作用。
据指出，二十日上午各巡防舰艇驶抵金马海域，经勤前检查后，将准时在中午十二点发动威力勤务，除了驱逐所有对岸越界船只，并配合防疫实行金马我船的登船临检，凡发现有屠体、动植物等走私物品，一律绝不宽贷。
据悉，原本仅有八艘巡防艇的马祖地区，增派七艘廿吨级以上的巡防舰艇，以及五艘巡防艇、五艘胶筏，将分散于东引、南竿、北竿、东莒、西莒等地区，扫荡中国渔船。
金门地区原本有六艘廿吨级以上的巡防舰艇，以及四艘巡防艇、四艘胶筏，现增派三艘廿吨级以上的巡防舰艇支援；至于澎湖地区则因现约有十艘的巡防艇，经评估已经足够，并没有再加派舰艇。
十九日的国安高层会议中，金马地区的防务与防疫能力受到重视，被认为是防止中国侵扰、疾病的第一线，尤其开放小三通增添管理复杂度使情势更为严峻，海巡署长许惠佑受命提出报告。
另据国安官员十九日晚指出，中国与台湾不论是否签有石油探勘的合作计画，中国若欲进入我专属经济海域，必须在半年前向台湾提出申请，并经台湾同意许可后，方可为之，“奋斗四号”数度擅入台湾海域均违反相关规定，基于国家安全与利益，台湾必须加以驱离。
中油探勘竟与中国合作
高层强调，两岸之间应该相互尊重，不能想来就来，况且海测船的功能不仅探油，包括水文等军事资讯皆可掌握，因此对岸应依照既定程序办理，以维护应有的秩序。
十八日遭海巡署船舰驱离的中国海测船“奋斗四号”，经查是中油公司与对岸中海油公司签订的合作探勘船只。陆委会官员表示，两岸确曾签约合作探勘油气，但其中有严格规定，必须先通报台方相关单位，并不是什么船都可以随便进来。
中国海测船“奋斗四号”，十七日上午被发现在高雄西南西方一百里处，海巡署接获国防部通知后，立即由南部机动海巡队调派“福星舰”、“钦星舰”前往驱离。
据了解，“奋斗四号”海测船是台湾的中油公司与对岸中国海洋石油公司签订的“石油合约”探勘计画一环，双方为了探勘海峡中线的海底石油天然气资源，在英属维京群岛另成立“台南潮汕凹陷石油作业公司”，并租用广州海洋探勘开发总公司的海测船“奋斗四号”，申请在今年八月于高雄西南西方外海九十二里处进行海底地质探勘，作业时间二至五天。
|“奋斗四号”申请核准的探勘座标是北纬二十二度二十二分、东经一百一十八度二十六分，但国防部发现该船的座标与核准座标有出入，差距约八至十里。官员认为，“奋斗四号”在今年五月间已经犯规侵入台湾海域，当时未提两岸石油公司合作之事，现在却临时提出，十分怪异，应是托辞。
台湾海巡署北区机动海巡队和星舰十七日起，分三航次，接运六十名军官与舢舨、巡逻艇十艘增援马祖，昨天把两艘胶筏及一艘巡逻艇吊上和星舰，晚间九时由基隆港启航，是增援马祖的最后一航次，将从二十日起对越区中国渔船进行大扫荡。
海巡署指出，领军的一千九百吨和星舰配合各单位支援海巡舰艇，将于增援军官、巡逻艇全数到位后，组成庞大的船队，对越区进入我马祖海域的中国渔船进行大扫荡。
南巡局于十七日接获海巡署调度命令，十八日上午将两艘小型港巡艇以陆运方式运抵基隆港，另有卅二名南巡局官兵也支援北上，经过勤前教育及任务分配后，南巡局的港巡艇及人员当天晚上由北部机动海巡队“和星舰”搭载出发，于十九日上午抵达马祖，投入打击小三通走私的任务。
