有关国际环保组织批评说，中国帮助柬埔寨兴建的两座最大的水坝，将对柬埔寨的自然生态环境造成威胁。
总部在美国的国际环保组织"国际江河"在星期一发布的一份报告中指出，由中国投资6亿美元兴建的这两座大坝，将对柬埔寨的自然生态环境带来严重破坏，并减缓当地经济的发展。其中一座大坝完全座落在柬埔寨一个国家公园的范围内，将淹没两千英亩被保护的森林。报告说，两座大坝在2010年建成后，还将影响当地居民的生产和生活，影响河流的自然形态，最终影响到柬埔寨经济的可持续发展。
就此，在美国的环保人士林俊达博士评论说，： "总体来说，现在大坝争议对生态环境角度来说，水坝对环境肯定会有不良的影响。如果是特别大的坝，那影响就更加厉害。从环境角度当然是不好的，当然，从发电、防洪这个因素就要综合考虑。但对生态环境是有害的。"
分析建水坝对生态环境会造成哪些不良影响，林博士说： "最主要的一个就是改变了整个水流的规律。原来是不停地流，现在是水流量减少，防水的时候水流量增大了，规律就改变了。很多种类经过了几千年、几万年都是靠水流的规律。水质都已经适应了这个情况。突然间人为地改变以后，很多种类就不能适应。还有就是污染，大坝建起来以后，上游的水就变成了不动水，储存起来以后污染了，不能及时排下去，也成问题。"
在美国的国际中国环境基金会总裁何平表示，建水坝因为是长久性工程，并且会对环境造成影响，应当谨慎。但如果柬埔寨的能源极度缺乏，也不是完全不可以考虑： "如果是缺煤，或者是缺别的资源，象是风能等，那因为水电相对来说污染还是比较小的。这就需要做一个评估，看看生态破坏能不能够减缓或者是维持到一定的程度。因为建坝也不是不可以的。"
何平说，与其它发电形式相比，水力发电是节约能源的措施之一，但要更多鼓励发展小水电： "应该主要发展小水电，因为它对生态破坏比较小，投资成本比较低。所以发展小水电就比较合适。要建大坝的话，从环保的角度、从经济的分析，还会有移民、文化等问题。所以，水电是再生、是可再利用。但是，高坝对整个生态系统有影响，还有河道堵塞，改道等影响。所以，高坝的建设要极度谨慎。"
法新社的报道援引柬埔寨有关非政府组织人士的话说，柬埔寨能源的极度匮乏是公认的事实，但政府可以采用其它办法，来解决柬埔寨的能源问题。
