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日中之间围绕有争议岛屿的领土纠纷升温之后，中国民间反日抗议活动对日企造成普遍的冲击，日本产品在中国港口的通关时间也明显延长。在这种充满不确定性的政治背景下，一些日本企业在考虑撤出中国市场，把业务转移到其他国家。
中国各地的激烈反日示威活动在中国政府的作用下已经平息下来，在抗议中受到暴力冲击的日系企业也纷纷恢复营业。但是，这次示威浪潮对日企造成的心理震荡可能是短期内无法消除的。
据路透社星期五公布的一项对在华日本企业的调查，有百分之41的企业认为和中国的领土纠纷影响到他们的企业规划，还有一些公司准备撤出中国市场，把业务转移到其他国家。
在日本政府宣布完成日中有争议岛屿的国有化之后的一个多星期里，中国各地纷纷发生反日抗议活动，一些日系企业遭到示威者打砸抢烧。这些无人居住的岛礁在中国称为钓鱼岛，日方称之为尖阁诸岛。
路透社对在中国的400家日本大中型企业进行了问卷调查，其中有260家在8月31日和9月14日之间做出了答复。路透社援引一家运输设备制造商的话说，“我们担心中国工人在日本工厂的生产线抵制生产，或者提出大幅度增加工资的没谱要求。”据分析，受冲击最大的是零售、运输设备和电子机械等领域。
除了民间行为的冲击之外，中国官方态度也在影响日企的营业。据日本朝日新闻报道，天津的海关官员对一些日本企业说，他们进口的物资可能要受到更多的检查。这意味着日本企业进口物资的通关时间会延长。本田汽车公司等一些日本企业已经表示要未雨绸缪，制定应急方案。
路透社援引一家日本机械公司说，“我们虽然遵守了零件出口的正常程序，但是物资还是耽搁在海关。”还有一家运输机械制造公司抱怨说，他们被禁止向官方项目投标。
鉴于日中领土纠纷是难以在短期内解决的棘手问题，日本公司担心这次的反日浪潮还会重复出现。分析人士说，一些日本公司会从长远的角度来重新考虑在中国的投资。日本公司可考虑选择的转战市场包括印尼、泰国和越南等国家。
数据显示，中日经济互相依赖的程度很高。根据一项估计，日本在中国的投资提供了一千万个工作机会，而廉价的中国产品为节俭度日的普通日本家庭节省了很多开支。更为严重的是，中国的稀土是日本依赖的重要战略资源。在上一次外交摩擦中，中国曾限制对日本的稀土出口。
即使没有这次外交摩擦，中日贸易发展已经在放缓。据中国海关总署公布的数字，中日贸易额去年增长了百分之14.3， 今年头8个月却下降了百分之1.4。虽然官方的解释是世界经济增长放缓，但是政治因素也产生了影响。
中国政府公布的数字显示，日本在华投资增长速度也在放缓，今年头8个月增长率只有百分之18，而去年同期的增长率高达百份之50。放缓的原因是日本公司想要到劳动力更便宜、没有敏感外交问题的国家投资。这次反日浪潮更加速了日本公司的这种战略思考。
一些经济界人士认为，如果两国政治关系继续恶化的话，对双方的经济发展都将产生不可估量的负面影响。
